Das vielfältige Repertoire der Kantorei St. Michaelis reicht von Heinrich Schütz über Johann Sebastian Bach und Wolfgang Amadeus Mozart bis zu John Rutter.
Alle zwei Jahre führt sie am Ewigkeitssonntag das Requiem sowie jedes Jahr am 1. Weihnachtstag die Krönungsmesse von Mozart auf.

Daneben hat die Kantorei bereits mehrere Uraufführungen von Kompositionen aus der Feder des Chorleiters Kirchenmusikdirektors Manuel Gera gemeinsam mit dem Orchester der Kantorei und dem Posaunenchor St. Michaelis durchgeführt:

• Credo Novum 2005
• Engel-Triptychon 2006
• Missa de Angelis 2007
• O komm, o komm Emanuel 2009
• Coventry Litanei 2016